Projet Collecte des Données Météo NASA

Voici la page web du groupe n°2 du module CNUM.

Vous trouverez sur cette page la description du projet et les livrables attendus.

Contexte

Ce projet s’inscrit dans le contexte du changement climatique et vise à analyser son impact sur la lactation des animaux, en particulier chez les brebis. L’objectif est de mieux comprendre les variations de production laitière en fonction des conditions environnementales afin d’optimiser les stratégies d’élevage. Pour cela, notre commanditaire prévoit d’exploiter des données environnementales issues des relevés de la NASA afin d’affiner l’évaluation des interactions génotype x environnement (GxE). Jusqu’à présent, ces données étaient collectées manuellement via des stations météorologiques ou directement à l’aide de capteurs installés dans les fermes. Le travail consiste à automatiser la récupération des données météorologiques, à les croiser avec les données de lactation fournies par le commanditaire (fichier lactation_data.txt) et à les associer aux exploitations recensées dans le fichier (ferme.txt), en fonction de leur localisation géographique.

Le livrable attendu est un script Python générant un fichier CSV mettant en relation la productivité laitière des brebis avec divers covariants environnementaux. Ainsi, chaque ligne correspond à une lactation, avec des colonnes indiquant l’identification de la brebis, sa ferme, sa production de lait, ainsi que les covariants associés. Un second script permettra ensuite de visualiser ces données sous la forme d’un corrélogramme illustrant les relations entre les covariants, ainsi que d’un diagramme en boxplot représentant les variations annuelles de chaque covariant.

Parties prenantes

• Étudiantes : BOUZIQUE Cloé, MICHAUX Léa, VENTURA Lisa
• Commanditaire : VITEZICA Zulma
• Expert technique : LANG Marc

Matériel

Nous avions à notre disposition 2 fichiers :

• Le fichier « fermes.txt », comprenant : Code de la ferme (43 fermes) et leur latitude et longitude associées

Le fichier « lactation_data.txt », comprenant : identification de l’animal, code de la ferme ( - année - mois), l'âge à la mise bas (MB), nombre de MB, nombre d’agneau vivant, intervalle MB (1er contrôle laitier), date de MB, production de lait à 120 jours, code de la ferme. Au total, le fichier contient 42 202 brebis et 130 451 lactations

Les ECs

Pour le choix des EC (environnementals covariants), nous nous sommes basées sur de la bibliographie (cf Sources). Nous avons retenu :

• Temperature at 2 m (°C) : T2M
• Dew/Frost temperature at 2 m (°C): T2MDEW
• Wet-bulb temperature at 2 m (°C)): T2MWET
• Earth surface temperature (°C): TS
• Relative humidity (%): RH2M
• Total precipitation at the surface of the earth (mm): PRECTOTCORR
• Wind speed at 2 m (m/s): WS2M
• Wind direction at 2 m (°): WD2M

Carte représentant la localisation des fermes

Nettoyage et traitement des données NASA

Affichage de la carte

Représentations graphiques

Fichier CSV

Voici un extrait du tableau reroupant les données extraites :

Graphiques

Voici un extrait des graphiques realisés :

Sources

• Davina Hill, Eileen Wall. Dairy cattle in a temperate climate : The effects of weather on milk yield and composition depend on management. Animal, 9(1), 138‑149. 2015. https://doi.org/10.1017/S1751731114002456
• Marguerite Gatbois. Influence du stress thermique sur la reproduction des ovins. Médecine vétérinaire et santé animale. 2024. ⟨dumas-04876334⟩
• Aurélie Vinet, Sophie Mattalia, Vallée Roxane, Christine Bertrand, Patrick Bertuzzi, et al. Etude de la tolérance à la chaleur des bovins par l’étude des interactions entre génotype et indice température humidité sur la production et la santé de la mamelle en race Montbéliarde. 26ème Rencontres Recherches Ruminants, Idele-Inrae, Dec 2022, Paris, France. pp.191-195. hal-04033244